表達(dá)DNA轉(zhuǎn)錄為mRNA，再翻譯為蛋白質(zhì)。不可濫用。mRNA產(chǎn)生后不一定就能翻譯為蛋白質(zhì)，如卵母細(xì)胞母源信息mRNA，受精卵發(fā)育初期才表。由mRNA被一些蛋白質(zhì)結(jié)合，也可能其他原因如小分子RNA作用。
mRNA的選擇性運(yùn)輸
細(xì)胞不同情況下選擇地將不同hnRNA加工成mRNA運(yùn)至細(xì)胞質(zhì)，--mRNA的選擇加工運(yùn)輸,一種通核孔的主動運(yùn)輸方式，可能機(jī)制大：1.依賴核孔復(fù)合體上受體蛋白對RNA分子的特異性識別，缺少識別信號便保留在核內(nèi)；2.不需要識別信號，除被特別保留在核內(nèi)的RNA外：其余RNA自動輸出細(xì)胞核；3.存在選擇輸出保留的聯(lián)合機(jī)制。
翻譯水平調(diào)節(jié)
主要是控制mRNA的穩(wěn)定性和mRNA翻譯起始的調(diào)控。
所謂在翻譯水平上的調(diào)節(jié)，是說基因轉(zhuǎn)錄的各種mRNA并不都能翻譯成蛋白質(zhì)，在不同細(xì)胞中有不同的mRNA得到翻譯，結(jié)果不同細(xì)胞具有不同的蛋白質(zhì)，細(xì)胞內(nèi)才有了差別（分化），是否有這種調(diào)節(jié)機(jī)制呢？
早就注意到在海膽未受精卵中存在著較穩(wěn)定（未活化）的mRNA，這種mRNA只有在受精后才能翻譯，稱為母體mRNA（maternal mRNA）。推測這種mRNA可能在未受精卵中被蛋白質(zhì)遮蓋，或被局限在細(xì)胞內(nèi)某一特定區(qū)域而不能被翻譯。而在受精后從這類束縛中解放出來，開始翻譯成蛋白質(zhì)。所以認(rèn)為，在真核細(xì)胞對基因表達(dá)調(diào)節(jié)的一條重要途徑是產(chǎn)生穩(wěn)定性的mRNA，處于隱蔽狀態(tài)，在一定條件下進(jìn)行翻譯。
除了和蛋白結(jié)合，不導(dǎo)致能翻譯為蛋白外，這里我要重點提出miRNA，可以對翻譯水平上進(jìn)行調(diào)節(jié)，使蛋白不表達(dá)或直接降解mRNA，主要研究的熱點是和腫瘤抑制基因和癌基因的關(guān)系。
mRNA代表基因轉(zhuǎn)錄水平，protein代表翻譯水平，表示功能，常常還要做免疫組化，進(jìn)行組織定位和亞細(xì)胞定位，三者不能互相替換，
雖然說mRNA和蛋白水平是一個相偶聯(lián)的過程，但是兩者沒有必然的一致的趨勢，因此不一定mRNA水平升高了就一定蛋白濃度就會提高，反之亦然。mRNA水平升高代表的是啟動子或者增強(qiáng)子的激活，也許是上游轉(zhuǎn)錄因子的激活，而蛋白水平的提高則大多數(shù)和功能增強(qiáng)相偶聯(lián)。機(jī)體是一個相互協(xié)調(diào)一致的整體，因此兩者的變化往往是相互偶聯(lián)的，因此驗證兩者的關(guān)系對于確認(rèn)某個基因的激活是相當(dāng)有力的。
免疫組化或者免疫熒光都是反應(yīng)細(xì)胞內(nèi)某種蛋白定位或者形態(tài)學(xué)上的一個大致的變化趨勢的，并不能確切說明變化的形式，因此我認(rèn)為如果缺少形態(tài)學(xué)的證據(jù)只要在蛋白水平驗證即可，畢竟都是反應(yīng)蛋白水平的，當(dāng)然反應(yīng)細(xì)胞內(nèi)定位的情況就另當(dāng)別論了。
細(xì)胞中蛋白水平取決于：
1.基因拷貝數(shù)和基因表達(dá)水平
2.信使RNA翻譯為蛋白質(zhì)的水平
3.蛋白質(zhì)在體內(nèi)降解的水平
基因表達(dá)有轉(zhuǎn)錄和翻譯兩個水平，但是調(diào)控就有很多水平，同一個基因可以有不同的轉(zhuǎn)錄本，而且mRNA可以有不同的剪接方式，因此一個基因可以有多個蛋白質(zhì)?；蜣D(zhuǎn)錄至mRNA其后再到蛋白質(zhì)還有幾個水平的調(diào)控，也可能mRNA不需要翻譯為蛋白，就降解了，也可能翻譯到一定水平后，獲得另外的信號，而停止翻譯
從mRNA到protein是一個復(fù)雜的調(diào)控過程：這種現(xiàn)象我以前聽說過，mRNA水平轉(zhuǎn)錄增多，但有可能翻譯前降解增加，也可能沒有翻譯出功能蛋白。蛋白降低，可能降解加速（是特異性或非特異性），可能產(chǎn)生多聚體，要考慮檢測手段。最重要的是考慮你試驗設(shè)計這個大背景，考慮出現(xiàn)這種現(xiàn)象的特定意義
真核蛋白還存在一個翻譯后加工問題。如果翻譯后加工不正確，蛋白可能被內(nèi)肽酶降解，也有可能活性降低。你可以做蛋白電泳，看蛋白的表達(dá)量是否變化.
轉(zhuǎn)錄和翻譯是兩個不同的過程，在某些特定的條件下可以脫節(jié)。但是首先要確定的確是mRNA升高，蛋白降低。請談?wù)勀阍诙縨RNA和蛋白表達(dá)水平時采用的方法！
機(jī)體存在生物鐘.即以24小時為周期,許多基因的表達(dá)在這段時間里存在峰值(量多)和谷值(量少).因此您研究的基因如果有周期波動,您的結(jié)果就wan全可能,因為有文獻(xiàn)報告蛋白的表達(dá)比mRNA滯后3小時左右,因此您在現(xiàn)有的采樣點后3小時再采樣,可能蛋白表達(dá)量就與已有結(jié)果mRNA高一致.
